Plus le référencement est intégré tôt dans le projet web, et mieux c'est.

Les actions de référencement peuvent intervenir à tout moment de la vie du site, et à tous les stades de sa construction ou de sa refonte.

Il reste que la façon la plus efficiente est d'intervenir dès la structuration du site et de son contenu. Le référencement prend à ce stade tout son sens, et son efficacité est supérieure, car la logique de visibilité est prise compte dès la conception et permet d'éviter les facteurs bloquant l'indexation et la pertinence.

La réponse à votre question est donc "au plus tôt", mais il n'est jamais trop tard pour bien faire.

Si aujourd'hui encore de nombreuses demandes de référencement sont faites après la mise en ligne du site, de plus en plus d'acteurs du web (entreprises, agences web ...) prennent cet aspect en compte et considèrent que le référenceur doit idéalement être indépendant (pour rester objectif), et s'intégrer au mieux dès le stade du cahier des charges.
Notre activité est de plus en plus orientée sur le conseil appliqué à la visibilité et son développement, et nous travaillons en réseau avec de nombreux professionnels du web et du dévelopement. La synergie mise en place permet d'optimiser les process de construction et d'édition de contenus.